農產品有機認證申請應向當地農業和農業三產品一標準管理辦公室提交。農村局，然后由農業農村局三品一標管理處工作人員對您的產品進行首次現場調查，看產品是否不符合申請的有機要求.認證要求，如能帶頭聯系相關權威國家認證機構進行檢測等一系列工作，可直接配合此外，如果不符合申請農產品有機認證的條件，農業農村局將實行三品一標。管理處的工作人員會直接告訴你原因。
一、有機認證申請流程：
1、申請人向有機食品認證分中心提出正式申請，領取《有機食品認證申請表》和交納申請費。
2、申請人填寫《有機食品認證申請表》，同時領取相關文件。
3、有機食品認證中心要求申請人按本標準的要求，建立本企業的質量管理體系、質量保證體系的技術措施和質量信息追蹤及處理體系。
二、申請者書面提出申請認證時，根據《有機產品認證實施規則》的規定，應向有機認證機構提交下列材料：
① 申請者的合法經營資質文件，如營業執照、土地使用證、租賃合同等;
② 申請者及有機生產、加工的基本情況，如申請者名稱、地址和聯系方式，生產、加工規模，包括品種、面積、產量、加工量等描述;
③ 產地(基地)區域范圍，包括地理位置圖、地塊分布圖、地塊圖;
④ 申請認證的有機產品生產、加工、銷售計劃;
⑤ 產地(基地)、加工場所有關環境質量的證明材料;
⑥ 有關專業技術和管理人員的資質證明材料;
⑦ 保證執行有機產品標準的聲明;
⑧ 有機生產、加工的質量管理體系文件;
⑨ 其他相關材料。
按照國家質檢總局《有機產品認證管理辦法》、國家認監委《有機產品認證實施規則》等法律法規和GB/T19630《有機產品國家標準》，企業要想將自己的產品作為有機產品銷售，必須通過有機認證。從事有機產品認證的機構必須獲得中國國家認證認可監督管理委員會(簡稱國家認監委，英文縮寫CNCA)的批準。國家認監委(CNCA)網站上對獲批的認證機構給予公布。只有獲得CNCA批準并與公布的認證機構才是合法的可從事認證活動的機構。可以在CNCA網站查詢其批準的認證機構目錄，具體辦法為CNCA網站——綜合服務專區——機構查詢——認證機構名錄——選擇有機產品(共分植物、畜禽、水產和加工四類)。
公眾還可以通過在CNCA網站的“食品農產品查詢”服務區查詢全國食品農產品認證企業名錄及其認證產品等信息。
按照農業部綠色食品、無公害農產品、有機食品認證工作“三位一體、整體推進”的戰略部署，有機食品認證程序及有機食品標志已正式啟用。
法律依據：
《有機認證管理辦法》
第七條　有機產品認證機構(以下簡稱認證機構)應當依法取得法人資格，并經國家認監委批準后，方可從事批準范圍內的有機產品認證活動。
認證機構實施認證活動的能力應當符合有關產品認證機構國家標準的要求。
從事有機產品認證檢查活動的檢查員，應當經國家認證人員注冊機構注冊后，方可從事有機產品認證檢查活動。
第八條　有機產品生產者、加工者(以下統稱認證委托人)，可以自愿委托認證機構進行有機產品認證，并提交有機產品認證實施規則中規定的申請材料。
認證機構不得受理不符合國家規定的有機產品生產產地環境要求，以及有機產品認證目錄外產品的認證委托人的認證委托。


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